Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SbdsP70122 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SbdsP70122 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SbdsP70122 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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