Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VdrP48281 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VdrP48281 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
VdrP48281 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
VdrP48281 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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VdrP48281 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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VdrP48281 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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VdrP48281 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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VdrP48281 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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VdrP48281 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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