Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms