Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms