Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms