Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Rabgef1Q9JM13 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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Rabgef1Q9JM13 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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Rabgef1Q9JM13 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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Rabgef1Q9JM13 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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Rabgef1Q9JM13 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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