Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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