Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Ccdc88cQ6VGS5 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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