Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Tsr1Q5SWD9 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Tsr1Q5SWD9 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Tsr1Q5SWD9 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Tsr1Q5SWD9 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Tsr1Q5SWD9 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Tsr1Q5SWD9 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Tsr1Q5SWD9 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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