Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms