Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms