Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Siah1bQ06985 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms