Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxc13P50207 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms