Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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VdrP48281 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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VdrP48281 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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VdrP48281 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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VdrP48281 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
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VdrP48281 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
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VdrP48281 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
VdrP48281 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
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VdrP48281 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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VdrP48281 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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VdrP48281 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VdrP48281 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VdrP48281 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VdrP48281 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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