Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprmP28828 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms