Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
P10404 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
P10404 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
P10404 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
P10404 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
P10404 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
P10404 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
P10404 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms