Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms