Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Speer3W4VSP1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms