Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26992S4R1A3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms