Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms