Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms