Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccne2Q9Z238 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms