Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk39Q9Z1W9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk39Q9Z1W9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms