Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ap3b1Q9Z1T1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms