Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PoleQ9WVF7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PoleQ9WVF7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms