Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcn5Q9WVD4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clcn5Q9WVD4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clcn5Q9WVD4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clcn5Q9WVD4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clcn5Q9WVD4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clcn5Q9WVD4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms