Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUA2

Farsb, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsbQ9WUA2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FarsbQ9WUA2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FarsbQ9WUA2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms