Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam50bQ9WTJ8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam50bQ9WTJ8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms