Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx6Q9R1R0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms