Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Lamc3Q9R0B6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lamc3Q9R0B6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms