Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d3cQ9QZS8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms