Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nphp1Q9QY53 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp1Q9QY53 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp1Q9QY53 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp1Q9QY53 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp1Q9QY53 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp1Q9QY53 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms