Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trpc5Q9QX29 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms