Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms