Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rai2Q9QVY8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms