Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcea2Q9QVN7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms