Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms