Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms