Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms