Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms