Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp2Q9JLK4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp2Q9JLK4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp2Q9JLK4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp2Q9JLK4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp2Q9JLK4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cabp2Q9JLK4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cabp2Q9JLK4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cabp2Q9JLK4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cabp2Q9JLK4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cabp2Q9JLK4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cabp2Q9JLK4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cabp2Q9JLK4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cabp2Q9JLK4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cabp2Q9JLK4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cabp2Q9JLK4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp2Q9JLK4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp2Q9JLK4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms