Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms