Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms