Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms