Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms