Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msgn1Q9JK54 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms