Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip3Q9JJR9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms