Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ercc6l2Q9JIM3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ercc6l2Q9JIM3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ercc6l2Q9JIM3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ercc6l2Q9JIM3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc6l2Q9JIM3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc6l2Q9JIM3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc6l2Q9JIM3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ercc6l2Q9JIM3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms