Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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