Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall1Q9ER74 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall1Q9ER74 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms